虽说反式脂肪几乎不存在于自然界，不过，明确说来，反式脂肪有两种来源，一种是天然的，一种是人工制造出来的。

　　1.天然的反式脂肪：

　　一般说来，天然的不饱和脂肪酸大多以顺式型态的结构存在，只有牛、羊等反刍动物因为特殊的消化道细菌的作用，会产生反式脂肪酸，因此，牛油、羊脂或相关的乳制品等会存在少量的反式脂肪酸。

　　此外，由于食用的饲料的关系，有些猪只或家禽也可能含有少量反式脂肪酸。天然的反式脂肪中，有一种共轭亚麻油酸(CLA)成分，具预防肥胖、动脉硬化、抗癌等作用。